آقای خویی در اوایل موضع تندتری نسبت به آقای خمینی به شاه داشت و در نامۀ آخر خطاب به شاه فرمودند که اگر دست از این کارهایت بر نداری حکم تکفیر تو را میدهم و تو را از دین خارج میدانم؛ حال آنکه آقای خمینی اینطور با شاه صحبت نکرد…