فهم عمیق و تبحر در طریق عرفان، فقه، ریاضیات، نجوم، شعر، فلسفه، هیات، طب و ادبیات از او استادی ذوالفنون ساخت که شاگردان، کتاب‌ها، تقریرها و تصحیح‌های بسیاری از او به جا گذاشت. این عالم ربانی و سالک لله در توصیف رهبر نظام سیاسی ایران، گفت: «اگر اسم کار من را لوس‌بازی نمی‌گذاشتند و اگر تلقی خوشی صورت می‌گرفت و مصون بود از تلقی‌های ناخوش، من کتاب «عیون مسائل النفس و سرح العیون فی شرح العیون» را که در مسائل نفس است می‌گذاشتم «عیون خمینی».